Le Terrier tchèque a pour ancêtres le Sealyham Terrier et le Terrier Ecossais. C'est, en effet, à partir de portées issues d'un mâle de la première race citée et d'une femelle de la seconde que le Terrier tchèque a été développé. L'objectif était alors d'obtenir une variété de terrier pour la chasse au renard et au blaireau. L'élevage de la race a débuté vers la fin des années 1940 par un dénommé Frantisek Horák de Klánovice, établi dans l'actuelle capitale de la République tchèque, Prague. 10 années plus tard, des Terriers tchèques sont présentés pour la première fois lors d'une exposition canine.