La race du Chien d'Eau Portugais est très ancienne. Elle aurait été développée en croisant diverses variétés locales et le Barbet. La province de l'Algarve, dans le Sud de l'actuel Portugal, est considérée comme son berceau historique. C'est là que le Chien d'Eau Portugais a continué d'être employé comme auxiliaire de pêche alors que ce rôle lui a été progressivement retiré dans les autres régions côtières du pays, du fait de la modernisation de l'activité halieutique. Il était également utilisé comme chien de liaison entre les embarcations et le rivage, portant notamment des messages.